知网查重被称为玄学的主要原因在于其不透明的算法和操作机制。知网作为国内较为权威的学术资源平台，其查重系统的具体运作方式并未公开，导致用户无法准确预测查重结果。此外，知网查重结果的准确性和稳定性也备受质疑，有时相同的文献在不同时间查重结果可能不同，缺乏一致性。这种不确定性和不可控性使得知网查重被许多人认为是一门玄学。

另外，知网查重还存在着一些技术上的难题，比如对抄袭文献的识别和匹配算法的准确性等方面的挑战。由于学术文献的复杂性和多样性，知网查重系统往往难以完全覆盖各种情况，容易出现漏检或误判的情况。因此，知网查重被戏称为玄学也在一定程度上反映了当前查重技术在某些方面的不足和局限性。